Trường THPT Dân lập Lý Thái Tổ được thành lập năm 2004 theo quyết định số 4582/QĐ-UB ngày 21/07/2004 của UBND Thành phố Hà Nội. Ngày 4/4/2013 trường được chuyển đổi từ loại hình trường dân lập sang loại hình trường tư thục theo Quyết định số 2434/QĐ-UBND với tên gọi trường THPT Lý Thái Tổ
